Fivesa
Wadah pengembangan minat bakat, kedisiplinan, kemanusiaan, serta jurnalistik murid MTsN 2 Kota Kediri.
Wadah Pembentukan Karakter & Jiwa Sosial
Komunitas organisasi Fivesa melatih kemandirian, kepedulian sosial, sportivitas, serta kreativitas murid melalui program-program pengabdian masyarakat dan kompetisi tingkat daerah maupun nasional.
OSIM adalah organisasi independen pada suatu madrasah yang anggotanya adalah seluruh murid. OSIM MTsN 2 Kota Kediri mengkoordinasikan seluruh kegiatan keekstraan baik akademik maupun non akademik.
UKS memiliki kegiatan yang aktif di lingkungan Madrasah seperti pendidikan kesehatan, pelayanan kesehatan, dan menjaga lingkungan sekolah bersih dan sehat.
Palang Merah Remaja madtsanda bergerak dalam bidang kesehatan, kebersihan, kemanusiaan, dan sosial, bersinergi untuk menciptakan lingkungan sekolah yang berprestasi, sehat, dan indah.
Patroli Keamanan Sekolah adalah wadah partisipasi pelajar yang berminat dalam bidang pengetahuan lalu lintas, khususnya mengatur penyeberangan di sekitar madrasah.
Pramuka madtsanda (Prasanda) memiliki regu tangguh bernama ScorVera (Scorpio-Aloevera), berakar dari tradisi kedisiplinan sejak berdirinya madrasah.
FIKRUNA adalah organisasi jurnalistik madrasah yang aktif meliput berbagai kegiatan madrasah, melatih keterampilan menulis dan jurnalistik murid, serta menerbitkan majalah tahunan secara profesional.